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50 - 基因组预测的基础(4) - ssGBLUP和H矩阵
2024-05-23 00:00:38 阅读数 1577
ssGBLUP经过10多年的发展，已经普遍开始应用在动物育种中。
以前的多步法
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基因组评估
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问题：
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表型的测量
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BLUP会低估基因组选择趋势
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一步法（ssGBLUP）
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展开的内容
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基因型的点估计问题
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假设基因型被视为特征
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使用 BLUP预测个体的基因组（Gengler's method）
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例如：
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增强基因型
Gengler 等人。 (2007) 构思了一种代数方法来处理这些点估计。
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缺失数据在经典处理
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fancy- 填充
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一步法是 将没有基因型动物作为缺失值处理
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推断基因型
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另一种不推断基因型，因为我们需要的是个体育种值
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所有动物的协方差
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两个创建ssGBLUP的想法
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第一种：
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联合分布
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转为所有个体的协方差
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H的逆很容易求出：
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理解H矩阵
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H矩阵的例子
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更复杂的例子
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H矩阵的一些特点
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ssGBLUP的混合方程组
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目前ssGBLUP的拓展模型
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